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植物Kunitz蛋白酶抑制剂的生物信息学分析

张亚光;黄勇;宋玉娇;陈访访;周嘉裕;廖海;   

  1. 西南交通大学生命科学与工程学院;
  • 出版日期:2011-12-26 发布日期:2011-12-26
  • 基金资助:
    教育部中央高校基本科研业务费专项资金项目(SWJTU09ZT28,SWJTU09CX065);;

  • Published:2011-12-26 Online:2011-12-26

摘要: 运用生物信息学的方法,对已在GenBank数据库中注册的大豆、海红豆、凤凰木、象耳豆及洋紫荆等植物Kunitz蛋白酶抑制剂的氨基酸序列进行分析。结果显示,这些植物的Kunitz蛋白酶抑制剂中甘氨酸、谷氨酸、亮氨酸、丝氨酸、天冬氨酸及缬氨酸含量较丰富;不同植物Kunitz蛋白酶抑制剂的氨基酸序列具有较高的同源性,其中P1位点的氨基酸残基序度保守;分子进化研究表明Kunitz蛋白酶抑制剂可作为植物遗传分化和分子进化研究的重要依据;部分序列中存在信号肽;分子中不存在跨膜结构域,可能受蛋白激酶C的磷酸化;无规卷曲是多肽链中的主要结构元件;分子中包含典型的STI功能结构域。

关键词: Kunitz蛋白酶抑制剂, 植物, GenBank, 生物信息学