牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的扩增与生物信息学分析

牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的扩增与生物信息学分析

赵文娟;田亮;薄新文;马勋;康立超;

新疆农垦科学院新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室;石河子大学动物科技学院;

出版日期:2012-01-26 发布日期:2012-01-26
基金资助:
新疆农垦科学院青年基金项目(YQJ201110),新疆农垦科学院引导计划项目(YYD201107)

Published:2012-01-26 Online:2012-01-26

摘要/Abstract

摘要： 旨在扩增牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的编码基因,并预测OmpH蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH在免疫保护中所起的作用。对牦牛多杀性巴氏杆菌的外膜蛋白OmpH基因进行PCR扩增及序列测定。应用生物信息学相关软件和方法,对牦牛多杀性巴氏杆菌OmpH蛋白的二级结构和B细胞抗原表位进行预测。牦牛多杀性巴氏杆菌OmpH基因全长1 478 bp,ORF包含1 002 bp编码333个氨基酸。二级结构以无规卷曲为主,有少量的α-螺旋和延伸带;推测OmpH蛋白有1个细胞黏附位点、2个糖基化位点。

关键词: 牦牛多杀性巴氏杆菌, 外膜蛋白H, 二级结构, B细胞抗原表位, 功能预测

赵文娟;田亮;薄新文;马勋;康立超;. 牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的扩增与生物信息学分析[J]. .

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