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毕赤酵母表达系统外源基因表达序列优化的软件设计

黄义德;杨林骥;张彦定;   

  1. 福建农林大学生命科学院,上海交通大学,发育与神经生物学福建省高校重点实验室 福建师范大学,,福州350108 发育与神经生物学福建省高校重点实验室,福建师范大学,农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点开放实验室,上海200030,福州350108 农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点开放实验室
  • 出版日期:2007-10-26 发布日期:2007-10-26
  • 基金资助:
    福建省教育厅资助项目(JA01015);; 福建省发改委资助项目(省发改2004[686号]);; 福建省自然科学基金(C0410008)

  • Published:2007-10-26 Online:2007-10-26

摘要: 作为真核生物表达系统,毕赤酵母已成功表达了包括病毒、细菌和真核生物在内的多种外源蛋白。但并非所有的外源序列在毕赤酵母中都能得以高表达,外源序列含有毕赤酵母中低频密码子或是序列中A+T含量不合理是限制高表达的重要原因。根据毕赤酵母密码子使用的有关特性,利用遗传算法,建立外源基因表达序列优化的数学模型,并依此设计一套毕赤酵母外源基因表达序列的优化软件。

关键词: 毕赤酵母, 密码子使用, 序列优化, 遗传算法