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蓝藻磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息学分析

侯李君;王学魁;施定基;   

  1. 天津科技大学海洋科学与工程学院;
  • 出版日期:2008-08-26 发布日期:2008-08-26
  • 基金资助:
    天津市科委重点攻关项目(043182711);; 国家自然科学基金资助(30670493);; 天津市高等学校科技发展基金项目(20040711)

  • Published:2008-08-26 Online:2008-08-26

摘要: 应用NCBI、Expasy等在线生物信息学网站对蓝藻磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)与其他物种进行序列同源比对,分析相同的保守序列及催化活性位点,构建分子进化树;预测跨膜结构、疏水性/亲水性、二级结构、功能域和模体等。结果显示,蓝藻PEPC与高等植物、细菌、真核藻PEPC同源性都比较低(约为33%),但是它们含有两个类似的活性部位和相同的催化活性位点;该蛋白质是非跨膜的亲水性不稳定蛋白,二级结构以a-螺旋和无规则卷曲为主,含有一个功能结构域,主要的功能是参与氨基酸的合成。

关键词: 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶, 生物信息学, 蓝藻(蓝细菌), 生物柴油