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拟南芥冷诱导CBF/DREB类结合因子的克隆及其生物信息学分析

刘俊;蔡平钟;张志雄;马林;向跃武;张志勇;王闵霞;   

  1. 四川省农业科学院生物技术核技术研究所;西南科技大学生命科学与工程学院;
  • 出版日期:2009-06-26 发布日期:2009-06-26
  • 基金资助:
    四川省农业科学院重点研究项目“主要农作物优质、抗逆基因克隆与利用研究”(2006-2010);; 四川省农业科学院重点研究项目“利用生物信息学克隆水稻生长激素及其结合蛋白基因的研究”项目

  • Published:2009-06-26 Online:2009-06-26

摘要: CBF/DREB结合因子广泛存在于植物中,主要参与诸如干旱、高盐以及冷胁迫等相关基因的表达调控。以拟南芥DNA为模板,PCR扩增出3个冷诱导的CBF/DREB结合因子,即CBF1、CBF2及CBF3,利用生物信息学手段对三者的cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、功能域、进化树、二级结构及DNA保守域的三级结构等进行了较为全面的分析。结果显示,CBF1、CBF2和CBF3的氨基酸序列同源性很高,达到91.4%,且都属于亲水性蛋白,三者在理化性质以及蛋白质二级结构乃至三级结构上也极为相似。另外,CBF1和CBF2都不具跨膜结构,CBF3含有1个跨膜螺旋。

关键词: CBF/DREB, 结合因子, 克隆, 生物信息学