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虾夷扇贝β-actin基因的克隆和序列分析

傅立元;高祥刚;李云峰;王健;赫崇波;   

  1. 辽宁师范大学生命科学学院;辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室;
  • 出版日期:2010-04-26 发布日期:2010-04-26
  • 基金资助:
    辽宁省科学技术计划重大重点项目(2008203001);; 辽宁省海洋与渔业科研计划项目(200801);; 国家海洋公益性行业科技专项(200805037)

  • Published:2010-04-26 Online:2010-04-26

摘要: 为进一步研究虾夷扇贝功能基因的表达调控。利用SMART cDNA文库构建试剂盒成功构建了健康虾夷扇贝外套膜和肾脏两种组织的cDNA文库。对随机选取的4009个克隆进行5′端测序,比对,筛选出1条β肌动蛋白同源序列,对此EST序列两端进行扩增、测序,得到肌动蛋白基因cDNA全长序列。肌动蛋白基因cDNA全长1536bp(不包括polyA),5′端非编码区84bp,3′端非翻译区321bp,阅读框1131bp,编码377个氨基酸。在基因组DNA中,该基因被一个内含子分为两段,内含子位于第41和第42个氨基酸之间,长度为1498bp。系统发育分析显示该肌动蛋白属于β类型。本研究得到的虾夷扇贝β-肌动蛋白基因可以被用于作为定量某种虾夷扇贝mRNA的标准,这为继续研究虾夷扇贝其它功能基因,及其分子生物的进一步研究、促进其他相关分子发育和系统进化研究奠定了基础。

关键词: 虾夷扇贝, cDNA文库, β-肌动蛋白, 基因克隆, 序列分析