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牡丹CTR1基因家族基因片段及其cDNA 3′-末端的克隆与序列分析

高娟;董丽;   

  1. 北京林业大学园林学院国家花卉工程技术研究中心;
  • 出版日期:2010-09-26 发布日期:2010-09-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(30972030);; 教育部博士点基金项目(20060022008)

  • Published:2010-09-26 Online:2010-09-26

摘要: 以牡丹品种‘洛阳红’(Paeonia suffruticosa‘Luo Yang Hong’)花瓣为材料,用CTAB法提取总RNA,根据已报道的CTR1(Constitutive Triple Response 1)蛋白的保守氨基酸序列设计简并引物,通过RT-PCR扩增得到3条牡丹CTR1基因同源片段。利用其已知中间序列,通过3′快速扩增cDNA末端技术(3′RACE)及序列拼接,最终得到了这3个基因片段除5′末端外的全部cDNA序列,分别命名为PsCTR1、PsCTR2和PsCTR3。分析结果表明,由PsCTR1、PsCTR2和PsCTR3基因翻译的氨基酸片段与拟南芥和番茄的CTR1蛋白氨基酸序列的同源性均较高,分别为88%和85%;61%和61%以及70%和69%。

关键词: 牡丹, CTR1, RT-PCR, RACE, 序列分析