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不同昆虫泛素基因部分序列的生物信息学分析

强承魁;杜予州;凤舞剑;王胜永;周保亚;胡忍;崔亚东;   

  1. 徐州生物工程职业技术学院农林工程系;扬州大学应用昆虫研究所;徐州生物工程职业技术学院科技产业处;阜阳师范学院生命科学学院;
  • 出版日期:2010-10-26 发布日期:2010-10-26
  • 基金资助:
    徐州生物工程高等职业学校校长基金项目(200901);; 安徽省农业科学院院长青年创新基金项目(2009A0908);; 国家重点基础研究发展规划(“973”计划)项目(2006CB102002)

  • Published:2010-10-26 Online:2010-10-26

摘要: 采用比较基因组学和生物信息学方法系统分析了NCBI中已公布的二化螟、棉卷叶螟和草地贪夜蛾等13种昆虫Ub基因及其氨基酸序列的结构特点、差异和遗传多样性及进化关系。结果表明,Ieu、Thr、Ile和Lys作为13种昆虫Ub的主要氨基酸,多呈碱性,无前导肽、信号肽和跨膜结构域,延伸带和无规则卷曲为主要结构元件,第57和22位点分别发生Ser和Thr磷酸化,总体呈亲水性。同时检测出96个多态位点,共生成13个单倍型,昆虫种间该基因具较丰富的遗传多样性。

关键词: 昆虫, 泛素基因, 生物信息学, 遗传变异