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两种鲤鱼胰凝乳蛋白酶原基因的电子克隆及分析

陈文波;李卫国;   

  1. 河南理工大学资源环境学院生物系;
  • 出版日期:2011-01-26 发布日期:2011-01-26
  • 基金资助:
    河南理工大学博士基金项目(B2010-7)

  • Published:2011-01-26 Online:2011-01-26

摘要: 为研究胰凝乳蛋白酶原在鱼类中的生理功能和作用机制,利用生物信息学的方法,成功获得了鲤鱼两种胰凝乳蛋白酶原的cDNA序列(ccCHTR1和ccCHTR2)并对其进行序列分析。结果显示,ccCHTR1 cDNA含有792 bp的开放阅读框,编码263个氨基酸;ccCHTR2 cDNA含有798 bp的开放阅读框,编码265个氨基酸。二者氨基端均含有18个氨基酸组成的信号肽,同时,在成熟肽的第15和16个氨基酸(R-I)之间存在一个切割位点。氨基酸比对结果显示,ccCHTR1和ccCHTR2具备胰凝乳蛋白酶原的保守结构特征,同时二者有72.8%的同源性,且都与斑马鱼有最高的同源性,分别是93.3%和73.5%。进化分析显示,二者分别与斑马鱼和鳕鱼亲缘关系最近,与哺乳动物的亲缘关系较远。

关键词: 鲤鱼, 胰凝乳蛋白酶原, 电子克隆, 表达序列标签, 生物信息学