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江苏海域几种绿潮藻类rDNA ITS序列分析

陈淑吟;胡传明;陆勤勤;孙中响;许广平;丁亚平;   

  1. 江苏省海洋水产研究所;苏州大学医学部基础医学与生物科学学院;
  • 出版日期:2011-03-26 发布日期:2011-03-26
  • 基金资助:
    江苏省海洋与渔业局渔业重点项目

  • Published:2011-03-26 Online:2011-03-26

摘要: 于2009年5-7月定点采集了江苏海域绿潮藻类,测定、分析了这些藻类核糖体rDNA ITS序列,并进行分类鉴定。研究结果显示,ITS+5.8S序列片段长度为552-578 bp,其中ITS1序列部分长度为179-182 bp,5.8S序列全长为155-158 bp,ITS2序列全长为180-196 bp,序列的平均GC含量(contents)为61.6%-63.3%,不同ITS序列存在不同的插入/缺失位点。扩增得到27个序列中有7个不同序列,依据NCBI数据库相似性查找、系统进化关系及遗传距离等分析结果,确定有4个种类:浒苔(Ulva prolifeya),缘管浒苔(U.linza),石莼属(Ulva sp.)1种及盘苔属(Blidingia sp.)1种。分析表明,ITS序列可作为石莼科种类鉴定的标记。

关键词: 绿潮藻类, 浒苔, 石莼, 盘苔, ITS序列, 分类鉴定