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陆地棉抗病基因同源序列的克隆与分析

简桂良;赵磊;张文蔚;齐放军;王升正;   

  1. 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室;
  • 出版日期:2011-10-26 发布日期:2011-10-26
  • 基金资助:
    国家转基因生物新品种培育科技重大专项子课题(2008ZX005-004);;

  • Published:2011-10-26 Online:2011-10-26

摘要: 根据已知抗病基因NBS保守区的P-loop和GLPL区设计一对简并引物F1/R1,以7个抗黄萎病陆地棉品种和2个感黄萎病品种的基因组DNA为模板进行PCR扩增。在9个品种中均扩增出500 bp左右的条带。对目的条带进行回收,连接、转化克隆得到350个阳性克隆,进行测序。在8个棉花品种中克隆到74条具有完整开放读码框的棉花RGAs序列。这74条序列共有64种不同的基因型,有10条与其他品种中的RGAs序列相同。用MEGA软件对8个棉花品种的74条RGA序列以及12个已知的抗病基因的NBS区域进行聚类分析,可分为4类;4类RGAs之间的相似性较低,各类之内的RGAs虽然来自不同品种,氨基酸序列的相似度却非常高。推测各大类中相似性较高的序列分别属于同一个基因家族,从位点上说可能处于同一个基因簇。

关键词: 棉花, 抗病基因同源序列, NBS