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重叠延伸PCR法扩增EB病毒BZLF1N-BLRF2融合基因及生物信息学分析

张毅;周淑艳;陈锐;孙业红;李体远;   

  1. 暨南大学附属第二医院深圳市人民医院临床医学研究中心;暨南大学药学院;
  • 出版日期:2012-03-26 发布日期:2012-03-26
  • 基金资助:
    暨南大学科研培育与创新基金研究项目(216113103);;

  • Published:2012-03-26 Online:2012-03-26

摘要: 利用重叠延伸PCR技术扩增EB病毒BZLF1N-BLRF2融合基因,构建原核表达载体pGEX-4T-1-BZLF1N-BLRF2,并进行了蛋白的诱导表达。通过序列测定和ORF软件分析,该融合基因含有1个1 005 bp的ORF,编码335个氨基酸。应用生物信息学方法,对该融合基因编码的蛋白ZtaN-p23从氨基酸组成、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、二级结构、亚细胞定位、功能域和高级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,该蛋白的预测分子量为46.2 kD,理论等电点约为8.97,是亲水性蛋白,推测它定位于细胞质中。序列分析表明,该蛋白可能具有信号转导、转录调控、免疫应答等功能。预测的二级结构及三级结构都表明该蛋白含有较多的不规则卷曲和α-螺旋,三级结构上呈对称形状。

关键词: 重叠延伸, PCR, EB病毒, BZLF1N基因, BLRF2基因, 生物信息学