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白色链霉菌乙酰木聚糖酯酶基因的克隆及生物信息学分析

汪文静;吴慧君;王晓宇;杨颖;厚凌宇;郑瑞珠;谢响明;   

  1. 北京林业大学生命科学与技术学院;
  • 出版日期:2012-06-26 发布日期:2012-06-26

  • Published:2012-06-26 Online:2012-06-26

摘要: 乙酰木聚糖酯酶可以水解乙酰化木聚糖中的O-乙酰取代基团,消除该基团对木聚糖酶水解的空间阻碍作用,增强木聚糖酶对木聚糖的亲和力和降解能力。以白色链霉菌基因组为模板,利用简并PCR和TAIL-PCR扩增获得长约741 bp阅读框片段,编码247个氨基酸。生物信息学分析表明,该多肽片段具有AXE1家族蛋白保守区域;与已知的乙酰木聚糖酯酶蛋白C端区相比,相似性较高,二级和三级结构空间排布特点极为相似;初步判定该多肽片段为白色链霉菌乙酰木聚糖酯酶的C端区域。

关键词: 白色链霉菌, 乙酰木聚糖酯酶, 基因克隆, 生物信息学