48个油橄榄品种的遗传多样性及聚类分析

生物技术通报 ›› 2013, Vol. 0 ›› Issue (3): 96-101.

48个油橄榄品种的遗传多样性及聚类分析

陈海云¹,陈少瑜¹,宁德鲁²,李瑞¹,李勇杰²,毛云玲¹,吴涛¹

1. 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室，昆明 650204 ；2. 云南省林业科学院，昆明 650204

收稿日期:2012-09-24 修回日期:2013-03-21 出版日期:2013-03-20 发布日期:2013-03-21
作者简介:陈海云，女，助理研究员，研究方向：经济林良种选育及栽培； E-mail: kmchenhy@163.com
基金资助:
云南省重点新产品开发计划项目（2009BB006）

Genetic Diversity and Clustering Analysis on 48 Olive Cultivars

Chen Haiyun¹, Chen Shaoyu¹, Ning Delu², Li Rui¹, Li Yongjie², Mao Yunling¹, Wu Tao1

1. Key Laboratory of Forest Plant Cultivation and Utilization,Yunnan Academy of Forestry,Kunming 650204 ；2. Institute of Economic Forest Trees,Yunnan Academy of Forestry,Kunming 650204）

Received:2012-09-24 Revised:2013-03-21 Published:2013-03-20 Online:2013-03-21

摘要/Abstract

摘要： 采用ISSR 分子标记技术对48 个引种和选育的油橄榄品种进行遗传多样性和聚类分析。11 条筛选出的引物共扩增出106 条DNA 谱带，其中有99 条为多态性条带，多态位点百分率为93.40%。数据表明所分析的油橄榄种质具有丰富的遗传多样性。根据各品种的Nei’s 遗传距离，运用UPGMA 方法构建了所有品种的聚类图，结果48 个油橄榄品种被聚成了4 个大类；84.6% 的国内选育品种聚于2 个类群中；多数引种品种并没有按照地理起源而是依据引种材料来源地和主要用途聚类。研究结果为油橄榄种质资源的利用以及进一步的良种选育提供参考。

关键词: 油橄榄, 遗传多样性, 聚类分析

Abstract: Inter-simple sequence repeat（ISSR）molecular markers were applied to analyze genetic diversity and clustering of 48 introduced and breeding olive cultivars. 106 bands were amplified by 11 selected primers,among which 99 bands were polymorphic. Percentage of polymorphic loci was 93.40%,which showed a rich genetic diversity in the collection. Based on Nei’s genetic distances,dendrogram of 48 cultivars was constructed through unweighted pair-group method（UPMGA）. 48 cultivars were clustered into 4 main groups. 84.6% of native select and breeding cultivars were clustered into 2 groups and most of introduced cultivars were clustered based on their directly introducing places and main usage. The results will provide references for olive resource utilization and further genetic improving.

Key words: Olea euyopaea, L. Genetic diversity, Clustering analysis

陈海云,陈少瑜,宁德鲁,李瑞,李勇杰,毛云玲,吴涛. 48个油橄榄品种的遗传多样性及聚类分析[J]. 生物技术通报, 2013, 0(3): 96-101.

Chen Haiyun, Chen Shaoyu, Ning Delu, Li Rui, Li Yongjie, Mao Yunling, Wu Tao. Genetic Diversity and Clustering Analysis on 48 Olive Cultivars[J]. Biotechnology Bulletin, 2013, 0(3): 96-101.

参考文献

[1] 吴开志, 肖千文, 贾瑞芬, 等. 油橄榄品种表型性状的多样性[J]. 经济林研究, 2008, 26(2):48-52.
[2] 姜成英, 戚登臣, 苏瑾. 甘肃省油橄榄生产现状与发展对策[J]. 经济林研究, 2006, 24(2):78-81.
[3] Belaj A, Satovic Z, Ralh L, et al. Optimal use of RAPD markers for identifying varieties in olive(Olea europaea L.)germplasm collections [J]. J Amer Soc Hort Sci, 2004, 129(2):266-270.
[4] Hagidinitriou M, Katsiotis A, Menexes G, et al. Genetic diversity of major Greek Olive cultivars using molecular(AFLP and RAPDs) markers and morphorlogical traits[J]. J Amer Soc Hort Sci, 2005, 130(2):211-217.
[5] Owen CA, Bita EC. Banilas G, et al. AFLP revealed structural detail of genetic diversity within cultivated olive germplasm from the Eastern Mediterranean[J]. Theor Appl Genet, 2005, 110 :1169-1176.
[6] Montemurro C, Sineone R, Pasqualone A, et al. Genetic relationships and cultivar identification among112 olive accessions using AFLP and SSR markers[J]. Hort Sciences, 2005, 80(1):105-110.
[7] Bemard R, Manzo M, Durante M, et al. Molecular markers for cultivar characterization in Olea europaea[J]. Acta Horticulturae, 2002, 586 :97-100.
[8] 邱源, 韩华柏, 李俊强. 23 个油橄榄品种的RAPD 分析[J]. 林业科学, 2008, 44(1):85-59.
[9] 马万里, Collins G. 运用RAPD 技术鉴定澳大利亚油橄榄品种的研究[J]. 内蒙古师范大学学报:自然科学汉文版, 2006, 35(3): 337-339.
[10] 李瑞, 陈少瑜, 宁德鲁, 等. 油橄榄ISSR-PCR 反应体系优化与引物筛选[J]. 安徽农业科学, 2012(10):5797-5799.
[11] Martins-Lopes P, Lima-Brito J, Gomes S, et al. RAPD and ISSR molecular markers in Olea europaea L. :Genetic variability and molecular cultivar identification[J]. Genetic Resources and Crop Evolution, 2007, 54 :117-128.
[12] Claros GM, Crespillo R, Aguilar ML. et al. DNA fingerprinting and classification of geographically related genotypes of olive tree(Olea europaea L.)[J]. Euphytica, 2000, 116 :131-142.
[13] Besnard G, Breton C, Baradat P, et al. Cultivar identification in olive based on RAPD markers[J]. J Amer Soc Hort Sci, 2002, 126 : 668-675.
[14] Rotondi A, Magli M, Ricciolini C, et al. Morphological and molecular analyses for the characterization if a group of Italy olive cultivars [J]. Euphytica, 2003, 132 :129-137.

[1]	于国红, 刘朋程, 李磊, 李明哲, 崔海英, 郝洪波, 郭安强. 不同基因型马铃薯对干旱胁迫的生理响应[J]. 生物技术通报, 2022, 38(5): 56-63.
[2]	周晓楠, 徐金青, 雷雨晴, 王海庆. 基于GBS-seq的青藏扁蓿豆SNP标记开发[J]. 生物技术通报, 2022, 38(4): 303-310.
[3]	王衍莉, 杨义明, 范书田, 赵滢, 许培磊, 路文鹏, 李昌禹. 基于SSR分子标记的73份山葡萄及杂交后代的遗传多样性分析[J]. 生物技术通报, 2021, 37(1): 189-197.
[4]	张乐超, 刘月琴, 段春辉, 张英杰, 王泳, 郭云霞. 7个地方山羊品种遗传多样性及遗传结构分析[J]. 生物技术通报, 2020, 36(6): 183-190.
[5]	李勇慧, 于相丽, 马会萍, 高凯, 刘名雪. 不同品种牡丹ISSR遗传多样性分析[J]. 生物技术通报, 2020, 36(4): 78-83.
[6]	李爱国, 李积铭, 李和平, 刘桂华, 宋聪敏, 武军艳. 适宜河北省旱寒区的冬油菜品种的筛选[J]. 生物技术通报, 2020, 36(1): 95-100.
[7]	赵昕鹏, 周云, 吕琳琳, 李锁平, 张大乐. 节节麦遗传多样性及在改良普通小麦中的应用[J]. 生物技术通报, 2019, 35(7): 181-189.
[8]	石建斌, 周红, 王宁, 许庆华, 乔文青, 严根土. 棉花SSR标记种质资源纯度鉴定及遗传多样性分析[J]. 生物技术通报, 2018, 34(7): 138-146.
[9]	赵宁, 陈双林. 竹黄遗传多样性与竹红菌素合成和抗癌作用的研究进展[J]. 生物技术通报, 2018, 34(4): 16-23.
[10]	武海月, 赵爽, 刘宇, 李华敏, 宋爽, 牛玉蓉, 荣成博. 榆黄菇遗传多样性的ISSR和SRAP综合分析[J]. 生物技术通报, 2018, 34(4): 121-126.
[11]	管俊娇, 杨晓洪, 张建华, 王江民, 张鹏, 李彦刚. 云南粳稻遗传多样性及群体结构分析[J]. 生物技术通报, 2018, 34(1): 90-96.
[12]	陈李鹏, 黄勇富, 赵永聚, 俄广鑫, 娜日苏. 采用6个微卫星位点研究6个绵羊品种遗传多样性[J]. 生物技术通报, 2016, 32(5): 91-98.
[13]	李言,刘延岭,崔翠菊,李晓捷,梁广津,彭捷,田萍萍. 海带种质资源遗传多样性的RAPD分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32(4): 151-158.
[14]	颜璐茜,李佳蔓,员涛,周安佩,纵丹,李旦,辛培尧,何承忠. 滇杨遗传多样性的SRAP分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32(4): 159-167.
[15]	戴习林, 高翔, 王海洋, 明磊, 江宗冰, 丁福江. 幼体发育速度不同的罗氏沼虾遗传结构分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32(2): 192-197.