一个融合魏斯氏菌隐蔽质粒的序列分析

doi:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.04.029

生物技术通报 ›› 2016, Vol. 32 ›› Issue (4): 217-221.doi: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.04.029

一个融合魏斯氏菌隐蔽质粒的序列分析

王海娟¹,戴雨珂²,苏森森¹,王英³,潘渠¹

1. 成都医学院病原生物学教研室，成都 610500 ;
2. 成都医学院公共卫生系，成都 610500 ;
3. 成都军区总医院肾内科，成都 610500

收稿日期:2015-08-13 出版日期:2016-04-25 发布日期:2016-04-26
作者简介:王海娟，女，研究方向：病原生物与感染性疾病研究；E-mail：934147264@qq.com
基金资助:
国家自然科学基金项目（31170007），四川省教育厅科技基金重点项目（14ZA0219），成都医学院病原生物学学科建设项目（CYXK2012005）

Complete DNA Sequence Analysis of a Cryptic Plasmid Isolated from Weissella confusa

WANG Hai-juan¹, DAI Yu-ke², SU Sen-sen¹, WANG Ying³, PAN Qu¹

1. Department of Pathogenic Biology，Chengdu Medical College，Chengdu 610500;
2. School of Public Health，Chengdu Medical College，Chengdu 610500;
3. Department of Kidney Disease，General Hospital of Chengdu Military Region，Chengdu 610500

Received:2015-08-13 Published:2016-04-25 Online:2016-04-26

摘要/Abstract

摘要： 从融合魏斯氏菌（WeissellaconfusaQJ012）中发现一个隐蔽质粒（pQJ012），测序结果显示该质粒大小为1489bp，碱基G+C含量为42.8%。BLAST结果显示该质粒的核苷酸序列同pJY33和pKLCA的同源性分别为93%、92%。ORF1编码一个282个氨基酸残基的复制蛋白（Rep），其氨基酸序列与质粒pJY33和pKLCA的同源性分别为91%、85%。根据复制蛋白、dso和sso的序列特征，推定pQJ012的复制方式为滚环复制，是滚环复制pT181家族成员。质粒pQJ012可能构建为良好的表达载体。

关键词: 融合魏斯氏菌, 隐蔽质粒, 序列分析, 复制蛋白

Abstract: A cryptic plasmid isolated from Weissella confusa QJ012，designated as pQJ012，was sequenced and characterized，and it was a 1489 bp circular molecule with a 42.8% G+C content. The result of BLAST showed that nucleotide sequence of pQJ012 was in homology with pJY33（93%）and pKLCA（92%）. ORF1 encoded a 282 amino acid residue Rep protein that was 91% identical to pJY33 and 85% identical to pKLCA in homology. Sequence analysis indicated that plasmid pQJ012 belonged to pT181 family of rolling-circle replication（RCR）. The pQJ012 may be constructed as a promising expression vector.

Key words: Weissella confuse, cryptic plasmid, sequence analysis, replication protein

王海娟,戴雨珂,苏森森,王英,潘渠. 一个融合魏斯氏菌隐蔽质粒的序列分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32(4): 217-221.

WANG Hai-juan, DAI Yu-ke, SU Sen-sen, WANG Ying, PAN Qu. Complete DNA Sequence Analysis of a Cryptic Plasmid Isolated from Weissella confusa[J]. Biotechnology Bulletin, 2016, 32(4): 217-221.

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