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玉米C_4型NADP-ME的生物信息学分析

李振华;张立军;崔震海;朱延姝;樊金娟;阮燕晔;汪澈;   

  1. 沈阳农业大学生物科学技术学院;
  • 出版日期:2009-03-26 发布日期:2009-03-26
  • 基金资助:
    辽宁省科技厅攻关项目(2008208001);; 辽宁省教育厅项目(2008S211);; 沈阳市科技局项目(1081191-3-00);; 沈阳农业大学青年基金(2007)

  • Published:2009-03-26 Online:2009-03-26

摘要: 利用生物信息学软件对GeneBank上注册的玉米C4型NADP-ME进行氨基酸组成、功能域、二级结构、疏水性、导肽、亚细胞定位、蛋白质功能及系统进化分析和预测。结果表明,NADP-ME蛋白是等电点为6.09的亲水性不稳定蛋白,包含一个结合NAD(P)的结构域和一个N-末端区域,属于裂解酶类,具有能量代谢的功能,定位于叶绿体中;α螺旋和不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,β折叠和伸展链散布其中;玉米C4型NADP-ME与高粱、水稻等植物的NADP-ME基因有较高的同源性。

关键词: 玉米, NADP-ME, 结构与功能预测, 进化树