绵羊DRB1基因生物信息学分析

绵羊DRB1基因生物信息学分析

徐飞;成述儒;罗玉柱;

甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室;

出版日期:2011-01-26 发布日期:2011-01-26
基金资助:
国家高技术研究发展计划项目(“863”计划)(2006AA10Z196);; 国家科技支撑计划项目(2007BAD52B05);; 甘肃省农业生物技术专项(GNSW-2009-24);; 甘肃省重点实验室建设计划项目(085RTSA004)

Published:2011-01-26 Online:2011-01-26

摘要/Abstract

摘要： 利用生物基因组学数据库,对绵羊MHCⅡ区DRB1基因进行生物信息学分析,以预测DRB1基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建DRB1同源基因的系统进化树。结果表明,DRB1基因编码产物为不稳定亲水性蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于29-30位的氨基酸之间。二级结构主要以无规则卷曲和延伸链为主,主要在细胞质中发挥生物学作用。序列分析表明,DRB1编码产物可能具有免疫应答和受体、胁迫应答和信号转导等功能,可能在免疫应答和胁迫应答过程中发挥重要作用,可能对绵羊免疫力和抗病性起关键作用。DRB1基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,绵羊DRB1与山羊、羚羊、塔尔羊和牛等物种DRB1氨基酸距离较近,具有高度同源性。

关键词: 主要组织相容性复合体, DRB1基因, 生物信息学, 绵羊

徐飞;成述儒;罗玉柱;. 绵羊DRB1基因生物信息学分析[J]. .

[1]	张路阳, 韩文龙, 徐晓雯, 姚健, 李芳芳, 田效园, 张智强. 烟草TCP基因家族的鉴定及表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(6): 248-258.
[2]	马钰静, 段春辉, 贺名扬, 张英杰, 杨若晨, 王泳, 刘月琴. 敲除G0S2基因对绵羊卵巢颗粒细胞增殖、类固醇激素及相关基因表达的影响[J]. 生物技术通报, 2023, 39(6): 325-334.
[3]	李敬蕊, 王育博, 解紫薇, 李畅, 吴晓蕾, 宫彬彬, 高洪波. 甜瓜PIN基因家族的鉴定及高温胁迫表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(5): 192-204.
[4]	郭三保, 宋美玲, 李灵心, 尧子钊, 桂明明, 黄胜和. 斑地锦查尔酮合酶基因及启动子的克隆与分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(4): 148-156.
[5]	王艺清, 王涛, 韦朝领, 戴浩民, 曹士先, 孙威江, 曾雯. 茶树SMAS基因家族的鉴定及互作分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(4): 246-258.
[6]	杨岚, 张晨曦, 樊学伟, 王阳光, 王春秀, 李文婷. 鸡 BMP15 基因克隆、表达模式及启动子活性分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(4): 304-312.
[7]	陈强, 邹明康, 宋家敏, 张冲, 吴隆坤. 甜瓜LBD基因家族的鉴定和果实发育进程中的表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(3): 176-183.
[8]	平怀磊, 郭雪, 余潇, 宋静, 杜春, 王娟, 张怀璧. 滇牡丹PdANS的克隆、表达及与花青素含量的相关性[J]. 生物技术通报, 2023, 39(3): 206-217.
[9]	邢媛, 宋健, 李俊怡, 郑婷婷, 刘思辰, 乔治军. 谷子AP基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(11): 238-251.
[10]	陈楚怡, 杨小梅, 陈胜艳, 陈斌, 岳莉然. ABA和干旱胁迫下菊花脑ZF-HD基因家族的表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(11): 270-282.
[11]	杨敏, 龙雨青, 曾娟, 曾梅, 周新茹, 王玲, 付学森, 周日宝, 刘湘丹. 灰毡毛忍冬UGTPg17、UGTPg36基因克隆及功能研究[J]. 生物技术通报, 2023, 39(10): 256-267.
[12]	杨小峰, 秦小伟, 郭泽媛, 吕丽华. 原花青素对体外培养绵羊卵泡颗粒细胞增殖的影响[J]. 生物技术通报, 2022, 38(9): 258-263.
[13]	郭志浩, 金泽鑫, 刘琦, 高利. 小麦矮腥黑粉菌效应蛋白g11335的生物信息学分析、亚细胞定位及毒性验证[J]. 生物技术通报, 2022, 38(8): 110-117.
[14]	于秋琳, 马婧怡, 赵盼, 孙鹏芳, 何玉美, 刘世彪, 郭惠红. 绞股蓝GpMIR156a和GpMIR166b的克隆与功能分析[J]. 生物技术通报, 2022, 38(7): 186-193.
[15]	陈佳敏, 刘永杰, 马锦绣, 李丹, 公杰, 赵昌平, 耿洪伟, 高世庆. 小麦组蛋白甲基化酶在杂交种中干旱胁迫表达模式分析[J]. 生物技术通报, 2022, 38(7): 51-61.

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