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平榛AGAMOUS基因的克隆与生物信息学分析

陈新;王贵禧;梁丽松;马庆华;   

  1. 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室;
  • 出版日期:2011-11-26 发布日期:2011-11-26
  • 基金资助:
    国家“十一五”科技支撑计划(2006BAD01A1701);;

  • Published:2011-11-26 Online:2011-11-26

摘要: 以野生平榛(Corylus heterophylla Fischer)为试材,采用RT-PCR方法从花芽中获得了一个平榛AGAMOUS基因cDNA,命名为ChAG,GenBank登录号为JN828811。序列分析结果表明,ChAG基因编码一个长度为726 bp,编码241个氨基酸的开放阅读框。氨基酸序列分析显示,该基因属于MADS家族AG亚家族。序列比对和系统进化分析表明,ChAG基因与欧榛的亲缘关系最近,相似性达99%。采用生物信息学手段对ChAG基因的保守结构域、疏水性和二级结构等进行分析。

关键词: 平榛, 基因克隆, 生物信息学