苋菜IRT1基因克隆、序列及表达分析

苋菜IRT1基因克隆、序列及表达分析

孙静文;赵世诚;范洪黎;周卫;

中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业部作物营养与施肥重点开放实验室;

出版日期:2012-02-26 发布日期:2012-02-26
基金资助:
国家自然科学基金项目(30800704);;

Published:2012-02-26 Online:2012-02-26

摘要/Abstract

摘要： 通过对镉超积累苋菜品种天星米铁转运蛋白基因(IRT1)的克隆、序列及表达分析,旨在为植物修复镉污染土壤奠定基础。依据同源克隆原理,通过RACE技术克隆苋菜IRT1基因及生物信息学方法分析基因序列结构和功能,Northern杂交研究基因表达。苋菜IRT1基因cDNA全长1 135 bp,包含完整的阅读框,编码322个氨基酸。苋菜IRT1蛋白与已知铁转运蛋白相似性在53.70%-63.04%,具有铁转运蛋白典型的功能结构特征,即N端含有1个信号肽、氨基酸序列上具有完整的ZIP家族功能结构域(Pfam:Zip)和7个跨膜结构域(TMs)。苋菜IRT1蛋白还具有1个COGO428超级家族(转运二价金属离子功能)、2个蛋白激酶C磷酸化位点和2个酪蛋白II磷酸化位点。低铁胁迫时苋菜根中IRT1基因表达量增加,加镉处理没有改变IRT1基因表达量。因此,推断苋菜IRT1基因是ZIP家族的一员,具有转运二价金属离子功能,将基因在GenBank中注册,序列号为:GU363501,命名为AmIRT1。

关键词: 苋菜, 铁转运蛋白, 克隆, 基因表达, IRT1基因

孙静文;赵世诚;范洪黎;周卫;. 苋菜IRT1基因克隆、序列及表达分析[J]. .

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