芽胞杆菌属种类脂肪酸鉴定的可靠性研究

生物技术通报 ›› 2013, Vol. 0 ›› Issue (6): 147-154.

芽胞杆菌属种类脂肪酸鉴定的可靠性研究

刘国红^{1, 2}, 刘波¹, 林乃铨²

(1.福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003;2.福建农林大学, 福州 350002)

收稿日期:2013-06-20 修回日期:2013-06-20 出版日期:2013-06-20 发布日期:2013-06-20
作者简介:刘国红, 女, 博士研究生, 研究方向: 芽胞杆菌分类及其功能;E-mail: liuguohong624@sina.com
基金资助:
国家“973”项目前期研究专项(2011CB111607), 农业部“引进国际先进农业科学技术”重点项目(“948”项目)(2011-G25)

Reliability Study on the Genus Bacillus Species Based on Fatty Acid Identification

Liu Guohong^{1, 2} Liu Bo¹ Lin Naiquan²

(1. Institue of Agricultural-Resource Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003;2. Fujian Agriculture and Forest University, Fuzhou 350002)

Received:2013-06-20 Revised:2013-06-20 Published:2013-06-20 Online:2013-06-20

摘要/Abstract

摘要： 选取10种芽胞杆菌模式菌株, 分别进行不同重复检测次数的脂肪酸鉴定。从脂肪酸鉴定结果、相似指数SI、脂肪酸含量和聚类分析4个角度研究了芽胞杆菌属种类脂肪酸鉴定的可靠性。通过脂肪酸鉴定, 10种芽胞杆菌可以准确地鉴定到种。鉴定指数SI与脂肪酸含量具有相关性, 与重复检测次数无关, 可得出脂肪酸鉴定指数重复性较好。芽胞杆菌属种类的脂肪酸组成和含量基本无变化或者变化很小, 聚类分析发现重复检测次数对芽胞杆菌的种分类地位无影响。研究结果表明芽胞杆菌脂肪酸鉴定具有较好的可靠性。

关键词: 芽胞杆菌, 脂肪酸, 可靠性, Sherlock, MIS系统

Abstract: In this study, 10 type Bacillus species were selected and carried out a different repeats of fatty acid respectively using Sherlock MIS system. From the identitication results, similarity index(SI), fatty acid content and clustering analysis, it was showed that all species were accurately identified as species level, SI had a good reproducibility, the fatty acid content was little changed in each pepetition, and was no effection on the taxonomic status of Bacillus species by clustering analysis. Finally, the results were determined that the Bacillus fatty acid identification had a good reliability.

Key words: Bacillus, Fatty acid, Reliability, Sherlock, MIS system

刘国红, 刘波, 林乃铨. 芽胞杆菌属种类脂肪酸鉴定的可靠性研究[J]. 生物技术通报, 2013, 0(6): 147-154.

Liu Guohong, Liu Bo, Lin Naiquan. Reliability Study on the Genus Bacillus Species Based on Fatty Acid Identification[J]. Biotechnology Bulletin, 2013, 0(6): 147-154.

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