合作猪SLA-DQA基因第4外显子多态性分析

生物技术通报 ›› 2014, Vol. 0 ›› Issue (2): 97-101.

合作猪SLA-DQA基因第4外显子多态性分析

张国华¹, 马小军^1，2, 吕伟丽¹

1.甘肃农业大学动物医学院，兰州 730037；2. 甘肃省草食动物生物技术重点实验室，兰州 730070

收稿日期:2013-08-23 出版日期:2014-02-27 发布日期:2014-02-27
作者简介:张国华，男，硕士研究生，研究方向：动物免疫与抗病；E-mail：664802394@qq.com
基金资助:
甘肃省自然科学基金项目（096RJZA005）

Analyzing Polymorphism of Hezuo Swine SLA-DQA Gene Exon 4

Zhang Guohua¹, Ma Xiaojun^1，2, Lü Weili¹,

（1. College of Veterinary Medicine，Gansu Agricultural University，Lanzhou 730070；2 Gansu Key Laboratory of Herbivorpous Animal Biotechnology，Lanzhou 730070）

Received:2013-08-23 Published:2014-02-27 Online:2014-02-27

摘要/Abstract

摘要： 合作猪的MHC-DQA基因的适应性变异，其抗原识别区域（即外显子4）通过PCR扩增和随后的单链构象多态性（SSCP）和序列分析，结果显示在439个合作猪个体，SLA-DQA第4外显子检出4个等位基因和6个基因型（AA、BB、DD、AB、AC和AD），其中A等位基因和AA基因型的频率最高，为优势基因和优势基因型。对不同型的PCR-SSCP条带测序分析，发现7个突变位点（5 068 bp T→C，5 109 bp和5 149 bp处缺失C，5 131 bp A→G导致丝氨酸变为甘氨酸，5 135 bp C→T，5 234 bp G→A，5 136 bp 处插入A）。遗传学分析发现，合作猪多态信息含量（PIC）为0.240 1，属于低度多态，各种基因型的分布不显著。研究结果证实，合作猪SLA—DQA基因第4外显子为低度多态。

关键词: 合作猪, SLA-DQA基因, 多态性, 遗传特性。

Abstract: The Hezuo swine SLA-DQA gene adaptive mutation, antigen recognition region（exon 4）by PCR amplification and subsequent single-strand conformation polymorphism（SSCP）and sequence analysis . The results show that 439 Hezuo swine individual SLA -DQA exon 4 detection of three alleles and six genotypes（AA, BB, CC, AB, AC, BC）the highest frequency of the A allele and AA genotype, genotype was the dominant gene and advantages .On a different type of PCR-SSCP pieces with sequencing analysis found that the fourmutated sites（5 068 bp T→C, 5 109 bp and 5 149 bp insert C, 5 131 bp A → G cause serine into glycine, 5 135 bp C → T, at 5 136 bp insert A, the 5 234 bp G → A lead tyrosyl acid becomes cysteine.Genetic analysis：cooperation pig polymorphic information content（PIC）was 0.240 1, belongs to the moderate polymorphism；significant distribution of various genotypes .The findings confirm that cooperation pig SLA - DQA gene the 4 exon has low rich genetic polymorphism .

张国华, 马小军, 吕伟丽. 合作猪SLA-DQA基因第4外显子多态性分析[J]. 生物技术通报, 2014, 0(2): 97-101.

Zhang Guohua, Ma Xiaojun, Lü Weili,. Analyzing Polymorphism of Hezuo Swine SLA-DQA Gene Exon 4[J]. Biotechnology Bulletin, 2014, 0(2): 97-101.

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