齐口裂腹鱼白介素-1β基因的克隆及表达谱

doi:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.02.014

生物技术通报 ›› 2017, Vol. 33 ›› Issue (2): 97-101.doi: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.02.014

齐口裂腹鱼白介素-1β基因的克隆及表达谱

段荟芹¹, 王利²

1. 西南民族大学青藏高原研究院,成都 610041;
2. 西南民族大学生命科学与技术学院,成都 610041

收稿日期:2016-06-16 出版日期:2017-02-26 发布日期:2017-02-08
作者简介:段荟芹,女,硕士生,研究方向：动物遗传学;E-mail：917077886@qq.com
基金资助:
四川省科技支撑项目（2016NZ0044）,西南民族大学研究生学位点建设项目（2016XWD-SO71007）

Cloning and Expression Profile of Interleukin-1β Gene in Schizothorax prenanti

DUAN Hui-qin¹, WANG Li²

1. Institute of Qinghai-Tibet Plateau,Southwest University for Nationalities,Chengdu 610041;
2. College of Life Science and Technology,Southwest University for Nationalities,Chengdu 610041

Received:2016-06-16 Published:2017-02-26 Online:2017-02-08

摘要/Abstract

摘要： 探讨齐口裂腹鱼白介素-1β（Interleukin-1β,IL-1β）基因的基本特点。用RT-PCR方法以齐口裂腹鱼脾脏cDNA作为模板扩增IL-1β基因,用生物信息学软件分析其序列,用RT-PCR方法检测IL-1β基因在齐口裂腹鱼6种组织的表达情况。克隆获得的IL-1β序列长1 252 bp,共编码276个氨基酸。GenBank 序列号为KU886235。IL-1β蛋白相对分子量为31.25 kD,等电点5.45,预测为亲水性蛋白。二级结构主要结构元件为随机卷曲和延伸链,有4个N-糖基化位点和16个磷酸化位点。NJ法系统进化树显示,齐口裂腹鱼与鲤鱼、鲫鱼的亲缘关系最近。组织表达分析显示,IL-1β基因主要在脾脏和肾脏中表达。这为深入研究鱼IL-1β的生物学功能提供理论依据。

关键词: 齐口裂腹鱼, 白介素-1β, 克隆, 蛋白质分析, 基因表达

Abstract: This work aims to characterize interleukin-1β（IL-1β）gene of Schizothorax prenanti. First,RT-PCR was used to amplify IL-1β gene with cDNA of S. prenanti spleen as template. Then,the IL-1β gene sequence was analyzed with various bioinformatics tools,and the expressions in 6 tissues of S. prenanti were detected used RT-PCR. As results,the length of IL-1β gene was 1 252 bp,and it encoded 276 amino acids. Its GenBank accession number was KU886235,the molecular weight of IL-1β was 31.25 kD,and pI was 5.45. It was induced as a hydrophilic protein,and its secondary structure mainly consisted of random coil and extended strand. There were 4 N-glycosylation sites and 16 phosphorylation sites in this protein. Phylogenetic relationships revealed that S. prenanti presented a closest genetic relationship with Cyprinus carpio and Carassius auratus. The analysis of tissue expression indicated that IL-1β gene was mainly expressed in the spleen and kidney. It provides theoretical evidence for further studying the biological function of IL-1β gene.

Key words: Schizothorax prenanti, interleukin-1β, cloning, protein analysis, gene expression

段荟芹, 王利. 齐口裂腹鱼白介素-1β基因的克隆及表达谱[J]. 生物技术通报, 2017, 33(2): 97-101.

DUAN Hui-qin, WANG Li. Cloning and Expression Profile of Interleukin-1β Gene in Schizothorax prenanti[J]. Biotechnology Bulletin, 2017, 33(2): 97-101.

参考文献

[1] 高珊, 余涛, 周景祥, 等. 鱼类白介素及其受体的研究[J]. 水产学杂志, 2014, 27（3）：62-64.
[2] Stylianou E, Saklatvala J. Interleukin-1[J]. International Journal of Biochemistry ＆ Cell Biology, 1998, 30（10）：1075-1079.
[3] Bird S, Zou J, Wang T, et al. Evolution of interleukin-1 beta[J]. Cytokine＆Growth Factor Reviews, 2002, 13（6）：483-502.
[4] Huising MO, Stet RJ, Savelkoul HF, et al. The molecular evolution of the interleukin-1 family of cytokines：IL-18 in teleost fish[J]. Dev Comp Immunol, 2004, 28（5）：395- 413.
[5] 崔国东, 张雪梅, 陈立杰. IL-1β在急性脑缺血中作用机制的研究进展[J]. 临床神经病学杂志, 2015, 28（6）：466-468.
[6] 崔波, 吴健. 颅脑损伤患者急性期白细胞介素-1β及细胞间黏附分子-1水平的变化[J]. 中国实用神经疾病杂志, 2015, 18（24）：13-14.
[7] 张玉彪, 柳云恩, 金红旭, 等. 大鼠低温爆震伤对肺组织中IL-1β和TNF-α表达的影响[J]. 临床急诊杂志, 2015, 16（9）：658-661.
[8] 韩俊源, 郭华, 张亚群, 等. PCV通过激活MyD88调控体外培养PAMs分泌IL-1β、IL-6和IL-10[J]. 畜牧兽医学报, 2014, 45（4）：647-653.
[9] Herath HM, Elvitigala DA, Godahewa G, et al. Molecular characterization and comparative expression analysis of two teleostean pro-inflammatory cytokines, IL-1β and IL-8, from Sebastes schlegeli[J]. Gene, 2016, 575（2Pt3）：732-742.
[10] 杨莹莹, 张其中, 李春涛, 等. 大鳍鳠IL-1β 基因 cDNA 克隆及表达分析[J]. 水产学报, 2012, 36（2）：321-328.
[11] 何江帅, 卢强, 李伟, 等. 鲤鱼白细胞介素-1β 全长 c DNA 的克隆·鉴定及其差异表达分析[J]. 安徽农业科学, 2011, 39（12）：7301-7304.
[12] 曾国航, 曹玉华, 王娟娟, 等. 多浪羊IL-1β基因的克隆及序列分析[J]. 新疆农业科学, 2013, 50（7）：1347-1352.
[13] Zou J, Grabowski PS, Cunningham C, et al. Molecular cloning of interleukin1β from rainbow trout Oncorhynchus mykiss reveals no evidence of an ICE cut site[J]. Cytokine, 1999, 8：552-560.
[14] 邱丽华, 冯娟, 江世贵, 等. 军曹鱼白细胞介素1β基因的克隆、分析及表达[J]. 中国水产科学, 2005, 12（2）：119-125.
[15] 蒋菁菁. 鲢补体C7和白细胞介素-1β基因的克隆、表达及序列分析[D]. 重庆：重庆师范大学, 2012.
[16] 何江帅. 鲤鱼白细胞介素一基因克隆、鉴定及时空转录分析[D]. 长春：吉林大学, 2011.
[17] Jiang SG, Zhang DC, Li JZ, et al. Molecular characterization, recombinant expression and bioactivity analysis of the interleukin-1β from the yellowfin sea bream, Acanthopagrus latus（Houttuyn）[J]. Fish＆Shellfish Immunol, 2008, 3：323-336.
[18] Lu DQ, Bei JX, Feng LN, et al. Interleukin-1β gene in orange-spotted grouper, Epinephelus coioides：Molecular cloning, expression, biological activities and signal transduction[J]. Molecular Immunology, 2008, 45（4）：857-867.
[19] Christman JW, Sadikot RT, Blackwell TS. The role of nuclear factor-κb in pulmonary diseases[J]. Chest, 2000, 117（5）：1482-1487.
[20] 金伯泉. 细胞和分子免疫学[M]. 第2版. 北京：科学出版社, 2001：134-146.
[21] Schindler R, Mancilla J, ENDRES S, et al. Correlations and interactions in the production of interleukin-6（IL-6）, IL-1, and tumor necrosis factor（TNF）in human blood mononuclear cells：IL-6 suppresses IL-1 andTNF[J]. Blood, 1990, 75（1）：40-47.
[22] Zou J, Bird S, Minter R, et al. Molecular cloning of the gene for interleukin-1 β from Xenopus laevis and analysis of expression in vivo and in vitro[J]. Immunogenetics, 2000, 51, （4）：332-338.
[23] Nielsen H, Engelbrecht J, Brunk S, et al. Identification of prokaryotic signal peptides and prediction of their cleavage sites[J]. Protein Engineering, 1997, 10（1）：1-6.
[24] Tsutsui S, Iwamoto T, Nakamura O, et al. LPS induces gene expression of interleukin-1β in congereel（Conger myriaster）macrophages：First cytokine sequence within Anguilliformes[J]. Fish＆Shellfish Immunology, 2007, 23（4）：911-916.

齐口裂腹鱼白介素-1β基因的克隆及表达谱

Cloning and Expression Profile of Interleukin-1β Gene in Schizothorax prenanti

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	杨志晓, 侯骞, 刘国权, 卢志刚, 曹毅, 芶剑渝, 王轶, 林英超. 不同抗性烟草品系Rubisco及其活化酶对赤星病胁迫的响应[J]. 生物技术通报, 2023, 39(9): 202-212.
[2]	吕秋谕, 孙培媛, 冉彬, 王佳蕊, 陈庆富, 李洪有. 苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆、亚细胞定位及表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(8): 194-203.
[3]	王佳蕊, 孙培媛, 柯瑾, 冉彬, 李洪有. 苦荞糖基转移酶基因FtUGT143的克隆及表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(8): 204-212.
[4]	孙明慧, 吴琼, 刘丹丹, 焦小雨, 王文杰. 茶树CsTMFs的克隆与表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(7): 151-159.
[5]	李帜奇, 袁月, 苗荣庆, 庞秋颖, 张爱琴. 盐胁迫盐芥和拟南芥褪黑素含量及合成相关基因表达模式分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(5): 142-151.
[6]	刘奎, 李兴芬, 杨沛欣, 仲昭晨, 曹一博, 张凌云. 青杄转录共激活因子PwMBF1c的功能研究与验证[J]. 生物技术通报, 2023, 39(5): 205-216.
[7]	赖瑞联, 冯新, 高敏霞, 路喻丹, 刘晓驰, 吴如健, 陈义挺. 猕猴桃过氧化氢酶基因家族全基因组鉴定与表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(4): 136-147.
[8]	郭三保, 宋美玲, 李灵心, 尧子钊, 桂明明, 黄胜和. 斑地锦查尔酮合酶基因及启动子的克隆与分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(4): 148-156.
[9]	杨俊钊, 张新蕊, 赵国柱, 郑菲. 新型GH5家族多结构域纤维素酶的结构与功能研究[J]. 生物技术通报, 2023, 39(4): 71-80.
[10]	陈强, 邹明康, 宋家敏, 张冲, 吴隆坤. 甜瓜LBD基因家族的鉴定和果实发育进程中的表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(3): 176-183.
[11]	刘思佳, 王浩楠, 付宇辰, 闫文欣, 胡增辉, 冷平生. ‘西伯利亚’百合LiCMK基因克隆及功能分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(3): 196-205.
[12]	陈楚雯, 李洁, 赵瑞鹏, 刘媛, 吴锦波, 李志雄. 藏鸡GPX3基因的克隆、组织表达谱研究及功能预测[J]. 生物技术通报, 2023, 39(3): 311-320.
[13]	姚晓文, 梁晓, 陈青, 伍春玲, 刘迎, 刘小强, 税军, 乔阳, 毛奕茗, 陈银华, 张银东. 二斑叶螨抗性木薯木质素合成途径基因表达特性研究[J]. 生物技术通报, 2023, 39(2): 161-171.
[14]	李彦霞, 王晋鹏, 冯芬, 包斌武, 董益闻, 王兴平, 罗仍卓么. 大肠杆菌型奶牛乳房炎对产奶性状相关基因表达的影响[J]. 生物技术通报, 2023, 39(2): 274-282.
[15]	杨旭妍, 赵爽, 马天意, 白玉, 王玉书. 三个甘蓝WRKY基因的克隆及其对非生物胁迫的表达[J]. 生物技术通报, 2023, 39(11): 261-269.