基于SSR标记的广东黄皮种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建

doi:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2023-0349

生物技术通报 ›› 2023, Vol. 39 ›› Issue (12): 187-199.doi: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2023-0349

基于SSR标记的广东黄皮种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建

陆育生(), 彭程, 常晓晓, 邱继水, 陈喆, 陈慧琼()

广东省农业科学院果树研究所农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省热带亚热带果树研究重点实验室，广州 510640

收稿日期:2023-04-15 出版日期:2023-12-26 发布日期:2024-01-11
通讯作者: 陈慧琼，女，博士，助理研究员，研究方向：果树栽培与育种；E-mail: chenhuiqiong@gdaas.cn
作者简介:陆育生，男，博士，研究员，研究方向：果树栽培与育种；E-mail: luyusheng@gdaas.cn
基金资助:
2022年省级乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022-NPY-00-036);2022年省级乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022-NBH-00-010);国家自然科学基金项目(31501729);广东省现代农业产业技术体系创新团队建设项目(2021KJ116);广东省现代农业产业技术体系创新团队建设项目(2022KJ116);国家热带植物种质资源库建设项目(NTPGRC)

Genetic Diversity Analysis and Molecular Identity Establishment of Clausena lansium Germplasm Resources from Guangdong Province Based on SSR Markers

LU Yu-sheng(), PENG Cheng, CHANG Xiao-xiao, QIU Ji-shui, CHEN Zhe, CHEN Hui-qiong()

Institute of Fruit Tree Research, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of South Subtropical Fruit Biology and Genetic Resource Utilization, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Guangdong Provincial Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fruit Tree Research, Guangzhou 510640

Received:2023-04-15 Published:2023-12-26 Online:2024-01-11

摘要/Abstract

摘要：

揭示广东黄皮种质资源的遗传多样性水平及亲缘关系，为黄皮种质资源的合理保护和高效利用提供参考依据。利用12对SSR引物分析广东黄皮种质资源的多态性，利用UPGMA进行聚类分析，通过数字和字母赋值编码构建分子身份证。12对引物在供试材料中共扩增出43个等位基因（Na），平均等位基因数3.583；期望杂合度（He）变幅为0.294-0.665，均值为0.524；多态性信息指数（PIC）变幅为0.291-0.642，均值为0.484；Shannon信息指数（I）变化范围为0.567-1.096，均值为0.913；UPGMA聚类可将84份种质划分为6个类群，并对每一份供试材料构建了分子身份证。广东黄皮种质资源具有较为丰富的遗传多样性，未严格按照地理来源进行聚类，通过赋值编码SSR扩增得到的基因型，构建了黄皮资源的分子身份证。

关键词: 黄皮, 种质资源, SSR, 遗传多样性, 分子身份证

Abstract:

This work aims to reveal the genetic diversity and relationship among Guangdong wampee germplasms, and provide reference for the effective protection and efficient utilization of wampee germplasm resources. The wampee germplasms from Guangdong province were examined using 12 pairs of SSR primers to determine their genetic diversity. UPGMA was utilized for cluster analysis, while numerical and letter codes were assigned to create molecular identity cards. The results showed that the 12 pairs of primers generated a total of 43 alleles（Na）, with an average of 3.583 alleles per locus in the 84 analyzed materials. The expected heterozygosity（He）ranged from 0.294 to 0.665, with a mean of 0.524. The polymorphism information content（PIC）ranged from 0. 291 to 0.642, with a mean of 0.484. The Shannon information index（I）ranged from 0.567 to 1.096, with a mean of 0.913. The 84 germplasms were divided into six groups based on UPGMA clustering, and molecular identity was established for each examined germplasm resource. Guangdong wampee germplasm resources have high genetic diversity, while their clustering was not strictly conducted by their geographical origins. Based on the SSR genotyping, a digital and letter-based coding method was used to construct the molecular identity card for wampee resources.

Key words: wampee, germplasm resources, SSR, genetic diversity, molecular ID

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图/表 9

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编号 No.	资源名称 Name of resource	种质类型 Type of germplasm	来源地 Origin	编号 No.	资源名称 Name of resource	种质类型 Type of germplasm	来源地 Origin
1	迟熟甜皮 Late maturing sweet wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	43	揭西甜皮 Jiexi sweet wampee	农家品种 Farm variety	揭阳 Jieyang
2	鹰嘴黄皮Yingzui wampee	农家品种Farm variety	广州 Guangzhou	44	龙门3号 Longmen No. 3	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
3	萝岗独核 Luogangduhe	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	45	龙门5号 Longmen No. 5	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
4	鸡心2号 Jixin No. 2	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	46	龙门6号 Longmen No. 6	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
5	大鸡心 Dajixin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	47	龙门7号 Longmen No. 7	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
6	鸡心3号 Jixin No. 3	农家品种 Farm variety	广州Guangzhou	48	龙门8号 Longmen No. 8	农家品种 Farm variety	惠州 Huizhou
7	迟熟鸡心 Late maturing jixin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	49	龙门10号Longmen No. 10	农家品种 Farm variety	惠州 Huizhou
8	从城鸡心 Congchengjixin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	50	连南2号 Liannan No. 2	地方种质 Local germplasm	清远 Qingyuan
9	郁南无核 Yunanwuhe	农家品种 Farm variety	云浮 Yunfu	51	连南3号 Liannan No. 3	地方种质 Local germplasm	清远 Qingyuan
10	大牛心 Daniuxin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	52	郁南1号 Yunan No. 1	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
11	白糖黄皮 Baitang wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	53	一级鸡心 Yijijixin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
12	鸡心5号 Jixin No. 5	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	54	黄埔1号 Huangpu No. 1	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
13	黄埔黄皮 Huangpu wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	55	黄埔3号 Huangpu No. 3	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
14	金鸡心 Jinjixin	审定品种 Validated selected variety	广州 Guangzhou	56	雅口2号 Yakou No. 2	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
15	从城黄皮 Congcheng wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	57	郁南3号 Yunan No. 3	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
16	新滘白糖 Xinjiaobaitang	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	58	郁南4号 Yunan No. 4	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
17	岐尖黄皮 Qijian wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	59	郁南5号 Yunan No. 5	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
18	岐山崛督 Qishanjuedu	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	60	郁南6号 Yunan No. 6	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
19	细鸡心2号 Xijixin No. 2	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	61	郁南7号 Yunan No. 7	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
20	大丰1号黄皮 Dafeng No. 1	审定品种 Validated selected variety	广州 Guangzhou	62	郁南8号 Yunan No. 8	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
21	阳山鸡心 Yangshanjixin	地方种质 Local germplasm	清远 Qingyuan	63	区根甜皮 Ougen sweet wampee	农家品种 Farm variety	云浮 Yunfu
22	塔下甜皮 Taxia sweet wampee	农家品种 Farm variety	梅州 Meizhou	64	芦庄1号 Luizhuang No.1	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou
23	塔下酸皮 Taxia sour wampee	农家品种 Farm variety	梅州 Meizhou	65	郁南珍珠Yunanzhenzhu	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
24	丰顺4号 Fengshun No. 4	农家品种 Farm variety	梅州 Meizhou	66	始兴032 Shixing 032	地方种质 Local germplasm	韶关 Shaoguan
25	禄田独核 Lutianduhe	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	67	罗定甜皮Luoding sweet wampee	农家品种 Farm variety	云浮 Yunfu
26	湛江1号 Zhanjiang No. 1	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	68	潮州8号 Chaozhou No. 8	地方种质 Local germplasm	潮州 Chaozhou
27	湛江2号 Zhanjiang No. 2	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	69	大埔5号 Dabu No. 5	地方种质 Local germplasm	梅州 Meizhou
28	海珠7号 Haizhu No. 7	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	70	大埔6号 Dabu No. 6	地方种质 Local germplasm	梅州 Meizhou
29	阳西1号 Yangxi No. 1	地方种质 Local germplasm	阳江 Yangjiang	71	潮州7号 Chaozhou No. 7	地方种质 Local germplasm	潮州 Chaozhou
30	阳西2号 Yangxi No. 2	地方种质 Local germplasm	阳江 Yangjiang	72	潮州10号 Chaozhou No. 10	地方种质 Local germplasm	潮州 Chaozhou
31	潮州1号 Chaozhou No. 1	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou	73	揭阳鸡心 Jieyangjixin	农家品种 Farm variety	揭阳 Jieyang
32	潮州2号 Chaozhou No. 2	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou	74	潮州11号 Chaozhou No. 11	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou
33	潮州5号 Chaozhou No. 5	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou	75	小果甜皮 Xiaoguo sweet wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
34	潮州6号 Chaozhou No. 6	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou	76	阳山大叶 Yangshandaye	地方种质 Local germplasm	清远 Qingyuan
35	大埔3号 Dabu No. 3	农家品种 Farm variety	梅州 Meizhou	77	廉江069 Lianjiang 069	农家品种 Farm variety	湛江 Zhanjiang
36	凤梢2号 Fengshao No. 2	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	78	廉江075 Lianjiang 075	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang
37	凤梢3号 Fengshao No. 3	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	79	龙山无核 Longshanwuhe	地方种质 Local germplasm	揭阳 Jieyang
38	凤梢4号 Fengshao No. 4	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	80	大埔4号 Dabu No. 4	地方种质 Local germplasm	梅州 Meizhou
39	凤梢5号 Fengshao No. 5	农家品种 Farm variety	湛江 Zhanjiang	81	兴宁4号 Xingning No. 4	地方种质 Local germplasm	梅州 Meizhou
40	凤梢6号 Fengshao No. 6	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	82	崛督4号 Juedu No. 4	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
41	龙门1号 Longmen No. 1	农家品种 Farm variety	惠州 Huizhou	83	龙门4号 Longmen No. 4	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
42	番禺甜皮 Panyu sweet wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	84	龙门9号Longmen No. 9	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou

编号 No.	资源名称 Name of resource	种质类型 Type of germplasm	来源地 Origin	编号 No.	资源名称 Name of resource	种质类型 Type of germplasm	来源地 Origin
1	迟熟甜皮 Late maturing sweet wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	43	揭西甜皮 Jiexi sweet wampee	农家品种 Farm variety	揭阳 Jieyang
2	鹰嘴黄皮Yingzui wampee	农家品种Farm variety	广州 Guangzhou	44	龙门3号 Longmen No. 3	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
3	萝岗独核 Luogangduhe	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	45	龙门5号 Longmen No. 5	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
4	鸡心2号 Jixin No. 2	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	46	龙门6号 Longmen No. 6	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
5	大鸡心 Dajixin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	47	龙门7号 Longmen No. 7	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
6	鸡心3号 Jixin No. 3	农家品种 Farm variety	广州Guangzhou	48	龙门8号 Longmen No. 8	农家品种 Farm variety	惠州 Huizhou
7	迟熟鸡心 Late maturing jixin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	49	龙门10号Longmen No. 10	农家品种 Farm variety	惠州 Huizhou
8	从城鸡心 Congchengjixin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	50	连南2号 Liannan No. 2	地方种质 Local germplasm	清远 Qingyuan
9	郁南无核 Yunanwuhe	农家品种 Farm variety	云浮 Yunfu	51	连南3号 Liannan No. 3	地方种质 Local germplasm	清远 Qingyuan
10	大牛心 Daniuxin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	52	郁南1号 Yunan No. 1	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
11	白糖黄皮 Baitang wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	53	一级鸡心 Yijijixin	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
12	鸡心5号 Jixin No. 5	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	54	黄埔1号 Huangpu No. 1	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
13	黄埔黄皮 Huangpu wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	55	黄埔3号 Huangpu No. 3	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
14	金鸡心 Jinjixin	审定品种 Validated selected variety	广州 Guangzhou	56	雅口2号 Yakou No. 2	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
15	从城黄皮 Congcheng wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	57	郁南3号 Yunan No. 3	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
16	新滘白糖 Xinjiaobaitang	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	58	郁南4号 Yunan No. 4	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
17	岐尖黄皮 Qijian wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	59	郁南5号 Yunan No. 5	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
18	岐山崛督 Qishanjuedu	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	60	郁南6号 Yunan No. 6	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
19	细鸡心2号 Xijixin No. 2	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	61	郁南7号 Yunan No. 7	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
20	大丰1号黄皮 Dafeng No. 1	审定品种 Validated selected variety	广州 Guangzhou	62	郁南8号 Yunan No. 8	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
21	阳山鸡心 Yangshanjixin	地方种质 Local germplasm	清远 Qingyuan	63	区根甜皮 Ougen sweet wampee	农家品种 Farm variety	云浮 Yunfu
22	塔下甜皮 Taxia sweet wampee	农家品种 Farm variety	梅州 Meizhou	64	芦庄1号 Luizhuang No.1	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou
23	塔下酸皮 Taxia sour wampee	农家品种 Farm variety	梅州 Meizhou	65	郁南珍珠Yunanzhenzhu	地方种质 Local germplasm	云浮 Yunfu
24	丰顺4号 Fengshun No. 4	农家品种 Farm variety	梅州 Meizhou	66	始兴032 Shixing 032	地方种质 Local germplasm	韶关 Shaoguan
25	禄田独核 Lutianduhe	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	67	罗定甜皮Luoding sweet wampee	农家品种 Farm variety	云浮 Yunfu
26	湛江1号 Zhanjiang No. 1	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	68	潮州8号 Chaozhou No. 8	地方种质 Local germplasm	潮州 Chaozhou
27	湛江2号 Zhanjiang No. 2	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	69	大埔5号 Dabu No. 5	地方种质 Local germplasm	梅州 Meizhou
28	海珠7号 Haizhu No. 7	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	70	大埔6号 Dabu No. 6	地方种质 Local germplasm	梅州 Meizhou
29	阳西1号 Yangxi No. 1	地方种质 Local germplasm	阳江 Yangjiang	71	潮州7号 Chaozhou No. 7	地方种质 Local germplasm	潮州 Chaozhou
30	阳西2号 Yangxi No. 2	地方种质 Local germplasm	阳江 Yangjiang	72	潮州10号 Chaozhou No. 10	地方种质 Local germplasm	潮州 Chaozhou
31	潮州1号 Chaozhou No. 1	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou	73	揭阳鸡心 Jieyangjixin	农家品种 Farm variety	揭阳 Jieyang
32	潮州2号 Chaozhou No. 2	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou	74	潮州11号 Chaozhou No. 11	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou
33	潮州5号 Chaozhou No. 5	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou	75	小果甜皮 Xiaoguo sweet wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
34	潮州6号 Chaozhou No. 6	农家品种 Farm variety	潮州 Chaozhou	76	阳山大叶 Yangshandaye	地方种质 Local germplasm	清远 Qingyuan
35	大埔3号 Dabu No. 3	农家品种 Farm variety	梅州 Meizhou	77	廉江069 Lianjiang 069	农家品种 Farm variety	湛江 Zhanjiang
36	凤梢2号 Fengshao No. 2	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	78	廉江075 Lianjiang 075	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang
37	凤梢3号 Fengshao No. 3	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	79	龙山无核 Longshanwuhe	地方种质 Local germplasm	揭阳 Jieyang
38	凤梢4号 Fengshao No. 4	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	80	大埔4号 Dabu No. 4	地方种质 Local germplasm	梅州 Meizhou
39	凤梢5号 Fengshao No. 5	农家品种 Farm variety	湛江 Zhanjiang	81	兴宁4号 Xingning No. 4	地方种质 Local germplasm	梅州 Meizhou
40	凤梢6号 Fengshao No. 6	地方种质 Local germplasm	湛江 Zhanjiang	82	崛督4号 Juedu No. 4	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou
41	龙门1号 Longmen No. 1	农家品种 Farm variety	惠州 Huizhou	83	龙门4号 Longmen No. 4	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou
42	番禺甜皮 Panyu sweet wampee	农家品种 Farm variety	广州 Guangzhou	84	龙门9号Longmen No. 9	地方种质 Local germplasm	惠州 Huizhou

引物名称 Primer name	正向引物 Forward primer sequence（5'-3'）	反向引物 Reverse primer sequence（5'-3'）	重复基元 Repeat motifs	退火温度Annealing temperature/℃
CP001	TGGTGACACATATAATGATCTTGG	ATGTGAAACCATCCCATCTCTTA	TGA（3*6）	58
CP002	TGGATAGAAAATGGTTGAGAGGA	TATGTCTTCCCGTTCCTGTTTTA	AC（2*10）	60
CP003	CATCAGTTGTGTTCACATTCACA	GTAGCCTTCATCAAAAGAGATGG	CAT（3*6）	59
CP004	TTTTCAACCCTCTTGAGTGAGAG	ATGTTTTGCTTCGATTGATTTGT	CCTCAA（6*4）	60
CP005	TCGGAAAGCCTCAGTAGTACAAG	AGGAGAGGCTATAGATCGTGGAT	TCAAAT（6*4）	60
CP006	AGTTTGGTAAATTCCCTGATGGT	CTACAACTTTGACACCACCTTCC	GAGCCT（6*4）	60
CP007	CAGAAACGACACTTGGAAACATC	AAGAACCCGCTCTCTTTTGTAAT	GGC（3*6）	59
CP008	AAATCAGAGGAAGAAAGGTGGAG	TCGACTTTCTGGTATCTGTCCAT	AGGGA（5*4）	60
CP009	CCCGTAAAACTTCAATTTCCTTC	GGGTTTTCTTCTACACACTCTCG	TG（2*9）	60
CP010	CGAAGTAGGACGAACTGAAAGAG	GATCTGACAATATTGGTGGTGGT	AGC（3*5）	60
CP011	TTCTCTCCGGAAAAATATCATTG	TTGTTCCTGCTAAATCTCGACTC	TGG（3*6）	60
CP012	ATGCTAGTTGCTAGTTGCTACCG	TCACTACTTGACAAGATCGGACA	CAGAAC（6*4）	60

引物名称 Primer name	正向引物 Forward primer sequence（5'-3'）	反向引物 Reverse primer sequence（5'-3'）	重复基元 Repeat motifs	退火温度Annealing temperature/℃
CP001	TGGTGACACATATAATGATCTTGG	ATGTGAAACCATCCCATCTCTTA	TGA（3*6）	58
CP002	TGGATAGAAAATGGTTGAGAGGA	TATGTCTTCCCGTTCCTGTTTTA	AC（2*10）	60
CP003	CATCAGTTGTGTTCACATTCACA	GTAGCCTTCATCAAAAGAGATGG	CAT（3*6）	59
CP004	TTTTCAACCCTCTTGAGTGAGAG	ATGTTTTGCTTCGATTGATTTGT	CCTCAA（6*4）	60
CP005	TCGGAAAGCCTCAGTAGTACAAG	AGGAGAGGCTATAGATCGTGGAT	TCAAAT（6*4）	60
CP006	AGTTTGGTAAATTCCCTGATGGT	CTACAACTTTGACACCACCTTCC	GAGCCT（6*4）	60
CP007	CAGAAACGACACTTGGAAACATC	AAGAACCCGCTCTCTTTTGTAAT	GGC（3*6）	59
CP008	AAATCAGAGGAAGAAAGGTGGAG	TCGACTTTCTGGTATCTGTCCAT	AGGGA（5*4）	60
CP009	CCCGTAAAACTTCAATTTCCTTC	GGGTTTTCTTCTACACACTCTCG	TG（2*9）	60
CP010	CGAAGTAGGACGAACTGAAAGAG	GATCTGACAATATTGGTGGTGGT	AGC（3*5）	60
CP011	TTCTCTCCGGAAAAATATCATTG	TTGTTCCTGCTAAATCTCGACTC	TGG（3*6）	60
CP012	ATGCTAGTTGCTAGTTGCTACCG	TCACTACTTGACAAGATCGGACA	CAGAAC（6*4）	60

引物名称 Primer name	等位基因数 Number of alleles（Na）	有效等位基因数 Effective number of alleles（Ne）	观测杂合度 Observed heterozygosity（Ho）	期望杂合度 Expected heterozygosity（He）	Shannon信息指数 Shannon's information index（I）	多态性信息量指数Polymorphic information（PIC）
CP001	4.000	1.879	0.317	0.468	0.880	0.455
CP002	4.000	1.964	0.500	0.491	0.873	0.460
CP003	4.000	2.530	0.537	0.605	1.051	0.564
CP004	3.000	2.340	0.675	0.573	0.944	0.507
CP005	3.000	2.092	0.512	0.522	0.874	0.452
CP006	3.000	1.416	0.265	0.294	0.567	0.291
CP007	3.000	2.984	0.595	0.665	1.096	0.591
CP008	4.000	2.083	0.582	0.520	0.922	0.518
CP009	6.000	2.327	0.542	0.570	1.076	0.516
CP010	3.000	2.846	0.675	0.649	1.072	0.642
CP011	3.000	2.033	0.429	0.508	0.840	0.433
CP012	3.000	1.744	0.333	0.427	0.761	0.386
总数 Total	43.000	26.239
均值 Mean	3.583	2.187	0.497	0.524	0.913	0.484

基于SSR标记的广东黄皮种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建

Genetic Diversity Analysis and Molecular Identity Establishment of Clausena lansium Germplasm Resources from Guangdong Province Based on SSR Markers

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分群 Group	种质数量 Number of germplasms	地域 Area	果实特性 Fruit characteristics
第I类群 Group I	13	西部 West region	果实性状多样 Diverse characteristics of fruits
第II类群 Group II	8	东部 East region	果实性状多样 Diverse characteristics of fruits
第 III类群 Group III	11	中西部Midwest region 全省各地区Various regions throughout the province	果实性状多样 Diverse characteristics of fruits
第 IV类群 Group IV	6	中部Central region	果实性状多样 Diverse characteristics of fruits
第 V类群 Group V	30	全省各地区 Various regions throughout the province	主要为鸡心黄皮类，果实为圆卵形或椭圆形、肉质细嫩、风味甜酸适中 Mainly Jixin wampee, fruits in round or oval-shaped and with tender flesh and a sweet and sour flavor
第VI类群 Group VI	16	全省各地区 Various regions throughout the province	主要为甜黄皮类，果皮浅黄色，肉质脆嫩，风味清甜，无酸味 Mainly sweet wampee, light yellow skin, crisp and tender flesh, a clear and sweet flavor and no sour taste

编号Code	CP001	CP002	CP003	CP004	CP005	CP006	CP007	CP008	CP009	CP0010	CP0011	CP0012
0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
1	111/111	106/106	82/88	105/105	116/116	107/119	91/91	87/90	130/130	114/114	108/108	98/98
2	111/121	106/108	85/85	105/111	116/122	107/131	91/94	90/90	130/133	114/120	108/114	98/104
3	111/124	106/110	85/88	105/117	116/128	119/119	91/100	90/105	133/133	114/123	108/124	98/110
4	112/121	106/112	85/91	111/111	122/122	119/131	94/94	102/105	133/142	120/120	114/114	104/104
5	112/124	108/108	88/88	111/117	122/128	131/131	94/100	105/105	133/145	120/123	124/124	104/110
6	121/121	108/112	88/91	117/117	128/128		100/100		133/156	123/123		110/110
7	121/124	112/112	91/91						142/142
8	124/124								142/145
9									145/145
a									156/156

资源名称Name of resource	分子身份证Molecular ID	资源名称Name of the resource	分子身份证 Molecular ID
迟熟甜皮 Late maturing sweet wampee	617563657525	揭西甜皮 Jiexi sweet wampee	617463537524
鹰嘴黄皮 Yingzui wampee	642651537544	龙门3号 Longmen No. 3	616233213114
萝岗独核 Luogangduhe	617551507224	龙门5号 Longmen No. 5	644613334235
鸡心2号 Jixin No. 2	642563204424	龙门6号 Longmen No. 6	617333354112
大鸡心 Dajixin	604551254224	龙门7号 Longmen No. 7	644423234212
鸡心3号 Jixin No. 3	214553557624	龙门8号 Longmen No. 8	614263658524
迟熟鸡心 Late maturing jixin	243554557424	龙门10号 Longmen No. 10	614553614335
从城鸡心 Congchengjixin	644553454224	连南2号 Liannan No. 2	817463335314
郁南无核 Yunanwuhe	740553234344	连南3号 Liannan No. 3	236463135514
大牛心 Daniuxin	243554507424	郁南1号 Yunan No. 1	22551313a312
白糖黄皮 Baitang wampee	216543557424	一级鸡心 Yijijixin	647553424354
鸡心5号 Jixin No. 5	644553454224	揭阳鸡心 Jieyangjixin	644553454224
黄埔黄皮 Huangpuhuagnpi	017453537624	潮州11号 Chaozhou No. 11	644553454224
金鸡心 Jinjixin	677553504244	黄埔1号 Huangpu No. 1	617563527515
从城黄皮 Congchenghuangpi	643553534524	黄埔3号 Huangpu No. 3	644553444224
新滘白糖 Xinjiaobaitang	617553637615	雅口2号 Yakou No. 2	116563234512
岐尖黄皮 Qijian wampee	617463530524	郁南3号 Yunan No. 3	813563134313
岐山崛督 Qishanjuedu	617563537524	郁南4号 Yunan No. 4	424433324334
细鸡心2号 Xijixin No. 2	644553457224	郁南5号 Yunan No. 5	127433227434
大丰1号黄皮 Dafeng No. 1	674353256124	郁南6号 Yunan No. 6	146653237311
阳山鸡心 Yangshanjixin	211331432511	郁南7号 Yunan No. 7	427463334612
塔下甜皮 Taxia sweet wampee	644451554514	郁南8号Yunan No. 8	426463334032
塔下酸皮 Taxia sour wampee	643453558324	区根甜皮Ougen sweet wampee	427463544525
丰顺4号 Fengshun No. 4	644521534524	芦庄1号 Luzhuang No. 1	644553454024
禄田独核 Lutianduhe	61755363a615	郁南珍珠Yunanzhenzhu	22551313a012
湛江1号 Zhanjiang No. 1	842363331613	始兴032 Shixing 032	616543354125
湛江2号 Zhanjiang No. 2	815563157316	罗定甜皮Luoding sweet wampee	617543637014
海珠7号 Haizhu No. 7	647251344644	潮州8号 Chaozhou No. 8	616162343535
阳西1号 Yangxi No. 1	217063553313	大埔5号 Dabu No. 5	615461354414
阳西2号 Yangxi No. 2	23745364a612	大埔6号 Dabu No. 6	611264354014
潮州1号 Chaozhou No. 1	644541557342	潮州7号 Chaozhou No. 7	205132254054
潮州2号 Chaozhou No. 2	667543247344	潮州10号 Chaozhou No. 10	215132244554
潮州5号 Chaozhou No. 5	644541547342	小果甜皮 Xiaoguo sweet wampee	636553254544
潮州6号 Chaozhou No. 6	614553557515	阳山大叶 Yangshandaye	146463534514
大埔3号 Dabu No. 3	617253337614	廉江069 Lianjiang 069	547565134524
凤梢2号 Fengshao No. 2	340564134616	廉江075 Lianjiang 075	376463137045
凤梢3号 Fengshao No. 3	715431113616	龙山无核 Longshanwuhe	245361559514
凤梢4号 Fengshao No. 4	376562157516	大埔4号 Dabu No. 4	255263653545
凤梢5号 Fengshao No. 5	614553637615	兴宁4号 Xingning No. 4	215260258212
凤梢6号 Fengshao No. 6	317464117326	崛督4号 Juedu No. 4	644553404224
龙门1号 Longmen No. 1	644563644315	龙门4号 Longmen No. 4	017263134114
番禺甜皮 Panyu sweet wampee	677553244324	龙门9号 Longmen No. 9	117463247514

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