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松江鲈鱼Cytb基因序列分析及种质鉴定

马亚;岳志芹;赵玉然;梁成珠;徐彪;汪东风;   

  1. 中国海洋大学;山东出入境检验检疫局;
  • 出版日期:2012-08-26 发布日期:2012-08-26
  • 基金资助:
    国家质检总局科研项目(2005IK053-3)

  • Published:2012-08-26 Online:2012-08-26

摘要: 采用PCR方法扩增四尾松江鲈鱼线粒体细胞色素b(mitochondrial cytochrome b,Cytb)基因序列,全序列长度为1 141 bp,并建立了松江鲈鱼的实时定量PCR检测方法对该物种进行种质鉴定。分析Cytb基因序列基本特征显示,Cytb基因在第3位密码子表现出明显的反G偏倚,显示出脊椎动物Cytb基因的共同特性。第2位密码子嘧啶的含量远高于嘌呤的含量,有5个位点发生转换,0个位点发生颠换。选取杜父鱼科(Cottidae)的10种鱼类,与松江鲈鱼进行序列分析,构建发育系统树并分析遗传距离,与鲈鱼的亲缘关系最远。以松江鲈鱼Cytb基因序列为靶基因,利用PRIMER EXPRESS2.0软件设计引物和Taqman探针,建立检测松江鲈鱼的定量PCR方法,特异性强,灵敏度高,检测限为3.20×102拷贝/反应。

关键词: 松江鲈鱼, 细胞色素b基因, 序列分析, 定量PCR, 种质鉴定