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河西绒山羊DRB3基因外显子2多态性分析

罗秀刚;马小军;张小丽;岳燕;李富强;姜力飞;   

  1. 甘肃农业大学动物医学院;甘肃省草食动物生物技术重点实验室;
  • 出版日期:2012-09-26 发布日期:2012-09-26
  • 基金资助:
    甘肃省农牧厅生物技术研究与开发项目(GNSW-2009-06);;

  • Published:2012-09-26 Online:2012-09-26

摘要: 研究采用PCR-SSCP方法检测1 046只河西绒山羊DRB3基因第2外显子的多态性,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因,分析各等位基因间的遗传关系和进化意义。结果表明,河西绒山羊DRB3基因第2外显子表现了18个等位基因(LG001-LG018)控制的31个基因型,LG005为优势等位基因,LG005*005为优势基因型,18个单倍型序列分析发现44个核苷酸多态位点、29个氨基酸多态位点;与GenBank下载序列比对分析结果表明,16个DRB3的等位基因是本研究首次发现;DRB3基因遗传多态指数中,观察杂合度为0.269 6,多态信息含量为0.869 9,有效等位基因数为1.369 1;经χ2适合性检验,该群体偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);18个DRB3基因外显子2的单倍型序列NJ系统发育树呈2支分化趋势。研究认为河西绒山羊DRB3基因第2外显子具有丰富的遗传多态性;河西绒山羊DRB3基因最初由2个等位基因突变分化成两大类等位基因。

关键词: DRB3基因, 多态性, PCR-SSCP, 河西绒山羊