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棉花抗逆相关基因GhDr1的克隆及生物信息学分析

丁忠涛;张锐;郭三堆;   

  1. 中国农业科学院生物技术研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程;
  • 出版日期:2011-01-26 发布日期:2011-01-26
  • 基金资助:
    农业部国家转基因重大专项(2008ZX005-004)

  • Published:2011-01-26 Online:2011-01-26

摘要: 通过TAIL-PCR的方法从棉花中克隆到未知功能的新基因GhDr1,生物信息学分析结果表明,GhDr1的预测蛋白含有酪氨酸激酶和蛋白酶C磷酸化位点、潜在的锌指类功能模块、MAPK磷酸化位点及MAPK相互作用识别位点;与GhDr1同源基因位于同一基因簇的基因多为参与逆境信号转导的蛋白。推测GhDr1基因可能在逆境信号转导途径的磷酸化级联反应中被调节,参与棉花逆境应答的生理过程。

关键词: 生物信息学, 棉花, GhDr1基因, TAIL-PCR, 抗逆