内生菌次生代谢产物提高玉米渗透胁迫抗性的表达谱分析

doi:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.07.013

生物技术通报 ›› 2016, Vol. 32 ›› Issue (7): 87-92.doi: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.07.013

内生菌次生代谢产物提高玉米渗透胁迫抗性的表达谱分析

王娜¹, 龚娜², 刘国丽², 马晓颖², 杨镇², 杨涛²

1. 辽宁省农业科学院植物营养与环境资源研究所辽,沈阳 110161；
2. 辽宁省农业科学院微生物工程中心,沈阳 110161

收稿日期:2015-10-16 出版日期:2016-07-25 发布日期:2016-07-25
作者简介:王娜,女,硕士,研究方向：植物内生菌;E-mail：wnsxh1999@126.com
基金资助:
辽宁省农业科技攻关项目（2011215005）,辽宁省科学事业公益研究基金项目（2013002002）

Expression Profile Analysis of Maize Resistance Under Osmotic Stress Induced by Secondary Metabolites of Endophytes

WANG Na¹, GONG Na², LIU Guo-li², MA Xiao-ying², YANG Zhen², YANG Tao²

1. Institute of Plant Nutrients and Environmental Resources,Liaoning Academy of Agricultural Sciences,Shenyang 110161;
2. Center of Microbial Engineering,Liaoning Academy of Agricultural Sciences,Shenyang 110161

Received:2015-10-16 Published:2016-07-25 Online:2016-07-25

摘要/Abstract

摘要： 利用基因芯片技术对10% PEG 渗透胁迫下植物内生菌次生代谢产物处理的玉米进行差异基因表达谱分析。结果显示,检测到的差异表达基因共计441个,其中上调表达基因147个,下调表达基因294个,参与21条代谢通路。采用晶芯生物分子功能注释系统 V 3.0（MAS）将差异表达基因进行GO功能分类,其中45%基因参与各种生物学过程;18%基因与生成各种细胞组分有关;36%基因编码产物则与执行各种分子功能有关;1%与GenBank 中功能未知序列相对应。KEGG 代谢分析表明差异表达基因广泛涉及基础物质代谢、能量代谢、次生代谢及信号转导途径。表达谱分析结果表明,在渗透胁迫下次生代谢产物对玉米的影响是一个多基因参与、多个生物途径协同调控的过程。

关键词: 内生真菌, 玉米, 渗透胁迫, 基因表达谱

Abstract: Genechip technology was used to analyze the expression profile of differential genes in corn treated by metabolites of endophyte under 10% PEG osmotic stress. The results showed that there were 441 differentially expressed genes identified in this study including 147 up-regulated genes and 294 down-regulated genes,participating in 21 metabolic pathways. The genes with differential expressions were classified by GO-ranking methods through CapitalBio Molecule Annotation System V 3.0（MAS）. Among them 45% participated in various biological processes,18% were related to synthesis of cellular components,the coded products of 36% genes were related to performing a variety of molecular function,and 1% corresponded with other unknown sequences in GenBank. Thus the role of these genes still needs further study. Pathways analysis using the KEGG pathway database showed the differentially expressed genes broadly were involved in basic metabolism,energy metabolism,secondary metabolism and signal transduction pathways. The expression profile analysis indicate that the effects of secondary metabolites on corn under osmotic stress are synergistical processes by many genes in many pathways.

Key words: endophyte, maize, osmotic stress, gene expression profile

王娜, 龚娜, 刘国丽, 马晓颖, 杨镇, 杨涛. 内生菌次生代谢产物提高玉米渗透胁迫抗性的表达谱分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32(7): 87-92.

WANG Na, GONG Na, LIU Guo-li, MA Xiao-ying, YANG Zhen, YANG Tao. Expression Profile Analysis of Maize Resistance Under Osmotic Stress Induced by Secondary Metabolites of Endophytes[J]. Biotechnology Bulletin, 2016, 32(7): 87-92.

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内生菌次生代谢产物提高玉米渗透胁迫抗性的表达谱分析

Expression Profile Analysis of Maize Resistance Under Osmotic Stress Induced by Secondary Metabolites of Endophytes

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